在石器时代5.0时期，最初了一项影响深远的功能，就是宠物融合系统。该系统中3只宠物可以相互融合，成为一只全新的宠物。在当时可以说是非常创新的功能，不过再后来被证明这个设定是石器极大的败笔。因为由于5.0融合宠破坏了宠物和平衡，导致纵然石器拥有数百种宠物，PK场却只剩下融合宠。好在石器解决了这些弊端。
故事背景
谣传魔族即将大举入侵伊甸大陆，恐龙博士的优秀弟子们，决定要以神秘的恐龙融合法，将恐龙进化为更强悍，更能抵抗大敌的新品种。恐龙进化是非常危险的，进化失败将会产生许多不可预期的后果，包含变成更弱小的物种或是完全不可控的巨大猛兽。这些新科恐龙博士，为了要融合出完美的新品种，正流浪在世介各地，并四处搜集更完整的恐龙品种。他们极需要各路勇士的协助，来驯服难以驾驭的珍贵宠物，当然，他们也非常乐意将自己的研究成果分享给每个协助他们研究的勇士。
宠物融合- 融合规则
| 1. | 融合宠无等级限制。 |
| 2. | 融合后产生一宠物蛋，需喂养营养剂才能使其孵化，蛋的喂养有时间限制，不到一小时无法喂食。 |
| 3. | 每一小时可喂养一次，喂养四十次后蛋会孵化。 |
| 4. | 蛋喂养的等级跟其本身等级无关，且蛋战斗所提升的等级对成长率没有加成的功用，蛋只可练至六十级。 |
| 5. | 营养剂主要是针对四种能力（体攻防敏），共有四个种类的药可以增加成长率，每一种营养剂又分为五级，等级越高的药，加的数值就越多。 |
| 6. | 饲养营养剂的来源，主要是打怪身上取得材料，再利用npc帮助磨药，组合两种材料来取得。 |
| 7. | 材料需要两种才能交给npc制药，一个来自打怪物掉落，一个来自加儿村任务所得到的龙骨粉末，龙骨粉末是每种营养剂所必备的，找药剂师结合二种药材成为药剂。 |
| 8. | 融合后之成品宠强度决定因素有二，一为融合宠之能力(包含三围及成长率)，二为宠物蛋营养剂喂食方法。 |
| 9. | 每两小时未喂养（除非寄放在宠物店不算时间，否则只要宠物蛋在身上，不论有无下线，都有计算时间喔），则扣掉之前所喂养之营养剂一颗，并随机扣五种等级营养剂所增加的成长率，且每次均扣四种属性。 |
| 10. | 融合完之宠物不得转生，但转生宠可用来融合 |
| 11. | 融合之宠物最多以三只为限，第一只称为主体，余皆称客体。 |
| 12. | 融合成功之宠物，外型均为全新宠(三代宠)。 |
融合材料
宠物融合分成两阶段，第一阶段是宠物融合成蛋，此阶段决定宠物蛋的属性、外型、技能、基本能力值，第二阶段为饲养宠物蛋，主要决定未来宠物诞生时的附加数值。
饲养的要诀
| 1. | 蛋的饲养，有设定孵化时间，（例如40小时为限，以宠物蛋在玩家身上线时间计算），在孵化期间，玩家可用药剂 喂养，有次数限制，例如最多40次为限。主要是针对四种能力（体防攻敏），各有四类药可以增加能 力值，每一种药又分为五级，等级越高的药，加的数值就越多。 |
| 2. | 饲养药剂的来源，主要是打怪身上取得材料，再利用npc磨药，组合两种材料来取得。 |
| 3. | 材料需要两个才能交给npc制药，一个来自打怪物掉落，一个来自解任务，完成任务后得到一个制药材 料（龙骨粉末），这个材料是制药必备的材料。找药剂师结合二种药材成为药剂。 |
| 4. | 打怪掉的材料，出现在特定怪物的身上，玩家必须到指定地点打怪，等级高的材料，掉落的机率越小。 |
药剂表
| 地 加血量 | 水 加防御力 | 火 加攻击力 | 风 加敏捷力 | |
| 一级药剂名 | 生命的白药粉 | 强化的白药丸 | 力量的白药汤 | 精力的白药丹 |
| 二级药剂名 | 生命的黄药粉 | 强化的黄药丸 | 力量的黄药汤 | 精力的黄药丹 |
| 三级药剂名 | 生命的绿药粉 | 强化的绿药丸 | 力量的绿药汤 | 精力的绿药丹 |
| 四级药剂名 | 生命的黑药粉 | 强化的黑药丸 | 力量的黑药汤 | 精力的黑药丹 |
| 五级药剂名 | 生命的红药粉 | 强化的红药丸 | 力量的红药汤 | 精力的红药丹 |
材料表
| 地 加血量 | 水 加防御力 | 火 加攻击力 | 风 加敏捷力 | |
| 一级材料名 | 水青果 | 水青藻 | 水青芽 | 水青蕨 |
| 二级材料名 | 麻黄果 | 麻黄藻 | 麻黄芽 | 麻黄蕨 |
| 三级材料名 | 金线果 | 金线藻 | 金线芽 | 金线蕨 |
| 四级材料名 | 新月果 | 新月藻 | 新月芽 | 新月蕨 |
| 五级材料名 | 双星果 | 双星藻 | 双星芽 | 双星蕨 |
| 任务材料名地点 | 加儿村中的巫师(龙骨粉末) | |||
怎样去融合你的宠物
寻找恐龙博士的弟子：渔村（85，87）